Publications des agents du Cirad

Cirad

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Agret Clément rss

Unité d'affectation : UMR AGAP (Bios)
Année de publication : Type de document :

5 publications

RedOak: A reference-free and alignment-free structure for indexing a collection of similar genomes

Agret C., Chateau A., Droc G., Sarah G., Ruiz M., Mancheron A.. 2022. Journal of Open Source Software, 7 (80) : 4 p..

DOI: 10.21105/joss.04363

Résumé

Article (b-revue à comité de lecture)

South Green resources to manage Rice Big Genomics Data [W682]

Agret C., Gottin C., Dereeper A., Tranchant-Dubreuil C., Chateau A., Diévart A., Sarah G., Mancheron A., Sempere G., Ruiz M., Droc G.. 2020. In : Abstracts workshops of the PAG XXVIII. San Diego : PAG, p. 302-302. Plant and Animal Genome. 28, 2020-01-11/2020-01-15, San Diego (Etats-Unis).

Résumé

Communication de congrès

Resources to manage Rice Big Genomics Data

Agret C., Gottin C., Dereeper A., Tranchant-Dubreuil C., Chateau A., Diévart A., Sarah G., Mancheron A., Ruiz M., Droc G.. 2019. Taipei : ISFRG, 1 p.. International Symposium of Rice Functional Genomics. 17, 2019-11-04/2019-11-06, Taipei (Taïwan).

Résumé

Communication de congrès

Next generation sequencing elucidates cacao badnavirus diversity and reveals the existence of more than ten viral species

Muller E., Ravel S., Agret C., Abrokwah F., Dzahini-Obiatey H., Galyuon I., Kouakou K., Jeyaseelan E.C., Allainguillaume J., Wetten A.. 2018. Virus Research, 244 : p. 235-251.

DOI: 10.1016/j.virusres.2017.11.019

Résumé

Article (a-revue à facteur d'impact)

Development of indexing compressed structure for analyzing a collection of similar genomes: application to rice

Agret C., Sarah G., Chateau A., Mancheron A., Ruiz M.. 2017. Lille : CNRS, p. 12-13. Journées Seqbio 2017, 2017-11-06/2017-11-07, Lille (France).

Résumé

Communication de congrès