Publications des agents du Cirad

Cirad

Cette sélection propose, pour chaque auteur du Cirad, les articles de revues, les ouvrages et les chapitres d'ouvrages, les actes de congrès, les thèses et les mémoires HDR référencés dans la base de données documentaire du Cirad, Agritrop. Un accès au texte intégral est proposé lorsqu'il est disponible.

Unité d'affectation : UMR AGAP (Bios)
Année de publication : Type de document :

34 publications

Sarah G., Homa F., Pointet S., Contreras S., Sabot F., Nabholz B., Santoni S., Sauné L., Ardisson M., Chantret N., Sauvage C., Tregear J., Jourda C., Pot D., Vigouroux Y., Chaïr H., Scarcelli N., Billot C., Yahiaoui N., Bacilieri R., Khadari B., Boccara M., Barnaud A., Péros J.P., Labouisse J.P., Pham J.L., David J., Glemin S., Ruiz M.. 2017. Molecular Ecology Resources, 17 (3) : p. 565-580.

Article de revue

Sauvage C., Rau A., Aichholz C., Chadoeuf J., Sarah G., Ruiz M., Santoni S., Causse M., David J., Glemin S.. 2017. Plant Journal, 91 (4) : p. 631-645.

Article de revue

Clément Y., Sarah G., Holtz Y., Homa F., Pointet S., Contreras S., Nabholz B., Sabot F., Sauné L., Ardisson M., Bacilieri R., Besnard G., Berger A., Cardi C., De Bellis F., Fouet O., Jourda C., Khadari B., Lanaud C., Leroy T., Pot D., Sauvage C., Scarcelli N., Tregear J., Vigouroux Y., Yahiaoui N., Ruiz M., Santoni S., Labouisse J.P., Pham J.L., David J., Glemin S.. 2017. PLoS Genetics, 13 (5) : e1006799 (28 p.).

Article de revue

Ruiz M., Sempere G., Hamelin C.. 2017. In : Van Dijk Aalt D.J. (ed.). Plant genomics databases: methods and protocols. New York : Springer [Etats-Unis], p. 161-172. (Methods in Molecular Biology, 1533).

Chapitre d'ouvrage

Sempere G., Philippe F., Dereeper A., Ruiz M., Sarah G., Larmande P.. 2016. GigaScience, 5 (25) : 9 p..

Article de revue

David J., Glemin S., Sarah G., Nabholz B., Sabot F., Holtz Y., Homa F., Pointet S., Contreras S., Sauné L., Ardisson M., Bacilieri R., Khadari B., Lanaud C., Pot D., Sauvage C., Scarcelli N., Tregear J., Vigouroux Y., Yahiaoui N., Ruiz M., Santoni S., Labouisse J.P., Pham J.L.. 2016. Le Sélectionneur Français (67) : p. 3-13.

Article de revue

Guignon V., Hueber Y., Rouard M., Bocs S., Couvin D., De Lamotte F., Droc G., Dufayard J.F., El Hassouni N., Farcy C., Gkanogiannis A., Hamelin C., Larivière D., Martin G., Ortega E., Pitollat B., Pointet S., Ruiz M., Gautier S., Summo M., This D., Ravel S., Larmande P., Monat C., Sabot F., Tando N., Tranchant-Dubreuil C., Sempere G., Dereeper A.. 2016. Current Plant Biology, 7-8 : p. 6-9.

Article de revue

Tagny Ngompé G., Venkatesan A., El Hassouni N., Ruiz M., Larmande P.. 2016. Ingénierie des Systèmes d'Information, 21 (5-6) : p. 133-157.

Article de revue

Dereeper A., Homa F., Andres G., Sempere G., Sarah G., Hueber Y., Dufayard J.F., Ruiz M.. 2015. Nucleic Acids Research, 43 (W1) : p. W295-W300.

Article de revue

Wu G.A., Prochnik S., Jenkins J., Salse J., Hellsten U., Murat F., Perrier X., Ruiz M., Scalabrin S., Terol J.F., Takita M.A., Labadie K., Poulain J., Couloux A., Jabbari K., Cattonaro F., Del Fabbro C., Pinosio S., Zuccolo A., Chapman J., Grimwood J., Tadeo F., Estornell L.H., Muñoz-Sanz J.V., Ibáñez V., Herrero-Ortega A., Aleza P., Pérez-Pérez J., Ramón D., Brunel D., Luro F., Chen C., Farmerie W.G., Desany B., Kodira C., Mohiuddin M., Harkins T., Fredrikson K., Burns P., Lomsadze A., Borodovsky M., Reforgiato G., Freitas-Astúa J., Quetier F., Navarro L., Roose M.L., Wincker P., Schmutz J., Morgante M., Machado M.A., Talon M., Ollitrault P., Gmitter F.G.J., Rokhsar D.S.. 2014. Nature Biotechnology, 32 : p. 656-662.

Article de revue

Nabholz B., Sarah G., Sabot F., Ruiz M., Adam H., Nidelet S., Ghesquière A., Santoni S., David J., Glemin S.. 2014. Molecular Ecology, 23 (9) : p. 2210-2227.

Article de revue

Droc G., Larivière D., Guignon V., Yahiaoui N., This D., Garsmeur O., Dereeper A., Hamelin C., Argout X., Dufayard J.F., Lengellé J., Baurens F.C., Cenci A., Pitollat B., D'Hont A., Ruiz M., Rouard M., Bocs S.. 2013. Database, 2013 (bat035) : 14 p..

Article de revue

Hamelin C., Sempere G., Jouffe V., Ruiz M.. 2013. Nucleic Acids Research, 41 (D1) : D1172-D1175.

Article de revue

Lacape J.M., Claverie M., Vidal R.O., Carazzolle M.F., Guimarães Pereira G.A., Ruiz M., Pré M., Llewellyn D., Al-Ghazi Y., Jacobs J., Dereeper A., Huguet S., Giband M., Lanaud C.. 2012. PloS One, 7 (11) : e48855 (16 p.).

Article de revue

Courtois B., Frouin J., Greco R., Bruschi G., Droc G., Hamelin C., Ruiz M., Clément G., Evrard J.C., Van Coppenole S., Katsantonis D., Oliveira M., Negrão S., Matos C., Cavigiolo S., Lupotto E., Piffanelli P., Ahmadi N.. 2012. Crop Science, 52 (4) : p. 1663-1675.

Article de revue

D'Hont A., Denoeud F., Aury J.M., Baurens F.C., Carreel F., Garsmeur O., Noël B., Bocs S., Droc G., Rouard M., Da Silva C., Jabbari K., Cardi C., Poulain J., Souquet M., Labadie K., Jourda C., Lengellé J., Rodier-Goud M., Alberti A., Bernard M., Correa M., Ayyampalayam S., Mckain M.R., Leebens-Mack J., Burgess D., Freeling M., Mbéguié-A-Mbéguié D., Chabannes M., Wicker T., Panaud O., Barbosa J., Hribova E., Heslop Harrison P., Habas R., Rivallan R., François P., Poiron C., Kilian A., Burthia D., Jenny C., Bakry F., Brown S., Guignon V., Kema G.H.J., Dita M.A., Waalwijk C., Joseph S., Dievart A., Jaillon O., Leclercq J., Argout X., Lyons E., Almeida A., Jeridi M., Dolezel J., Roux N., Risterucci A.M., Weissenbach J., Ruiz M., Glaszmann J.C., Quetier F., Yahiaoui N., Wincker P.. 2012. Nature, 488 (7410) : p. 213-217.

Article de revue

Ruiz M.. 2012. Montpellier : UM2, 35 p.. Habilitation à diriger des recherches -- Systèmes intègres en biologie.

HDR

Rouard M., Carpentier S.C., Bocs S., Droc G., Argout X., Roux N., Ruiz M.. 2012. In : Pillay Michael (ed.), Ude George (ed.), Kole Chittaranjan (ed.). Genetics, genomics and breeding of bananas. Enfield : Science Publishers, p. 194-216. (Genetics, genomics and breeding of crop plants).

Chapitre d'ouvrage

Rosero C., Argout X., Ruiz M., Teran W.. 2011. BMC Proceedings, 5 (7) : p. 178-178. Tree Biotechnology Conference from Genomes to Integration and Delivery, 2011-06-26/2011-07-02, Bahia (Brésil).

Article de revue

Courtois B., Greco R., Bruschi G., Frouin J., Ahmadi N., Droc G., Hamelin C., Ruiz M., Evrard J.C., Katsantonis D., Oliveira M., Negrão S., Cavigiolo S., Lupotto E., Piffanelli P.. 2011. Plant Genetic Resources, 9 (2) : p. 233-235.

Article de revue

Dereeper A., Nicolas S., Le Cunff L., Bacilieri R., Doligez A., Péros J.P., Ruiz M., This P.. 2011. BMC Bioinformatics, 12 (134) : 14 p..

Article de revue

Argout X., Salse J., Aury J.M., Guiltinan M.J., Droc G., Gouzy J., Allègre M., Chaparro C., Legavre T., Maximova S.N., Abrouk M., Murat F., Fouet O., Poulain J., Ruiz M., Roguet Y., Rodier-Goud M., Barbosa-Neto J.F., Sabot F., Kudrna D., Ammiraju J.S.S., Schuster S.C., Carlson J.E., Sallet E., Schiex T., Dievart A., Kramer M., Gelley L., Shi Z., Bérard A., Viot C., Boccara M., Risterucci A.M., Guignon V., Sabau X., Axtell M.J., Ma Z., Zhang Y., Brown S., Bourge M., Golser W., Song X., Clément D., Rivallan R., Tahi G.M., Akaza J.M., Pitollat B., Gramacho K.P., D'Hont A., Brunel D., Infante D., Kébé I.S., Costet P., Wing R., Mc Combie W.R., Guiderdoni E., Quetier F., Panaud O., Wincker P., Bocs S., Lanaud C.. 2011. Nature Genetics, 43 (2) : p. 101-108.

Article de revue

Courtois B., Ahmadi N., Khowaja F.S., Price A.H., Rami J.F., Frouin J., Hamelin C., Ruiz M.. 2009. Rice, 2 (2-3) : p. 115-128.

Article de revue

Lescot M., Piffanelli P., Ciampi A., Ruiz M., Blanc G., Leebens-Mack J., Da Silva F., Santos C.M.R., D'Hont A., Garsmeur O., Vilarinhos A.D., Kanamori H., Matsumoto T., Ronning C., Cheung F., Haas B., Althoff R., Arbogast T., Hine E., Pappas Junior G., Sasaki T., Souza M., Miller R.N.G., Glaszmann J.C., Town C.. 2008. BMC Genomics, 9 (58) : 20 p..

Article de revue

Larmande P., Gay C., Lorieux M., Perin C., Bouniol M., Droc G., Sallaud C., Perez P., Barnola I., Biderre-Petit C., Martin J., Morel J.B., Johnson A.A.T., Bourgis F., Ghesquière A., Ruiz M., Courtois B., Guiderdoni E.. 2008. Nucleic Acids Research, 36 : p. 1022-1027.

Article de revue

Wanchana S., Thongjuea S., Jun Ulat V., Anacleto M., Mauleon R.P., Conte M., Rouard M., Ruiz M., Krishnamurthy N., Sjolander K., Van Hintum T., Bruskiewich R.. 2008. Nucleic Acids Research, 36 : p. 943-946.

Article de revue

Bruskiewich R., Senger M., Davenport G., Ruiz M., Rouard M., Hazekamp T., Takeya M., Doi K., Satoh K., Costa M., Simon R., Balaji J., Akintunde A., Mauleon R.P., Wanchana S., Shah T., Anacleto M., Portugal A., Jun Ulat V., Thongjuea S., Braak K., Ritter S., Dereeper A.. 2008. International Journal of Plant Genomics, 2008 : 6 p..

Article de revue

Argout X., Fouet O., Wincker P., Gramacho K.P., Legavre T., Sabau X., Risterucci A.M., Da Silva C., Cascardo J.C.M., Allègre M., Kuhn D.N., Verica J., Courtois B., Loor R.G., Babin R., Sounigo O., Ducamp M., Guiltinan M.J., Ruiz M., Alemanno L., Machado R., Phillips W., Schnell R.J., Gilmour M., Rosenquist E., Butler D.R., Maximova S.N., Lanaud C.. 2008. BMC Genomics, 9 (512) : 19 p..

Article de revue

Dereeper A., Argout X., Billot C., Rami J.F., Ruiz M.. 2007. BMC Bioinformatics, 8 (465) : 10 p..

Article de revue

Bruskiewich R., Davenport G., Hazekamp T., Metz T., Ruiz M., Simon R., Takeya M., Lee J., Senger M., McLaren G., Van Hintum T.. 2006. OMICS - A Journal of Integrative Biology, 10 (2) : p. 215-219.

Article de revue

Ruiz M., Rouard M., Raboin L.M., Lartaud M., Lagoda P., Courtois B.. 2004. Nucleic Acids Research, 32 : D364-D367.

Article de revue

Sarrauste De Menthière N., Terrière S., Pugnère D., Ruiz M., Demaille J., Touitou I.. 2003. Nucleic Acids Research, 31 (1) : p. 282-285.

Article de revue

Pugnère D., Ruiz M., Sarrauste De Menthière N., Masdoua B., Demaille J., Touitou I.. 2003. Nucleic Acids Research, 31 (1) : p. 286-290.

Article de revue