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Cirad

Rapport de mission au Hatherly C2 Laboratory, University of Exeter (U.K.) du 18 au 26 février 2000

Jaligot E.. 2000. Montpellier : CIRAD-CP, 20 p.. numero_rapport: CP_SIC 1227.

Cette mission a été effectuée par l'auteur dans le cadre de sa thèse sur financement Projet Alliance 2000 (British Council/Egide). Cette collaboration constitue une étape fondamentale dans la mise au point de tests de détection de l'anomalie mantled basés sur des différences de méthylation à l'intérieur de séquences cibles, grâce à l'apprentissage de la technique de "bisulfite sequencing". La réaction au bisulfite repose sur la capacité du bisulfite de sodium à provoquer préférentiellement la déamination des cytosines en uracile. Une application extrêmement intéressante de cette technique est l'amplification PCR subséquente au traitement, réalisée au moyen d'amorces conçues en fonction de la conversion des cytosines de la séquence. On peut ainsi obtenir, après séquençage de l'amplicon, une réponse directe en fonction du statut de méthylation de la séquence donnée. La maîtrise complète de ctte approche, ainsi que des techniques multiples qui en dérivent, exige une connaissance étendue des phénomènes physico-chimiques mis en jeu. En effet les risques d'artefacts sont nombreux et peuvent conduire à des interprétations erronées du résultat de la réaction.

Mots-clés : elaeis guineensis; embryogénèse somatique; variation somaclonale; méthylation; adn; trouble de différenciation sexuelle; sonde nucléique; cytosine; technique analytique; royaume-uni

Rapport de mission

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