Des ravageurs des cultures plus virulents ou résistants aux pesticides apparaissent. Le cotonnier n'est pas épargné. Les chercheurs analysent les facteurs de régulation de ces populations puis expérimentent des solutions avec les agriculteurs. Le Cirad, en complément d'une protection chimique raisonnée, propose des pratiques culturales et des variétés ayant un certain degré de résistance à un ravageur considéré. Différentes méthodologies pour la caractérisation de biotypes et la transformation génétique du cotonnier sont décrites. Des programmes de protection sont développés en Afrique de l'Ouest, comme la lutte étagée ciblée : le calcul d'un seuil économique permet d'ajuster les produits et leurs doses en fonction des résultats d'observations de terrain. Les agriculteurs économisent ainsi 40 à 50 % des quantités de produits. Les observations constituent le principal facteur limitant : une formation soutenue et des adaptations locales sont nécessaires. Les expériences acquises permettent d'envisager une simplification de ces observations. La prévention et la gestion de la résistance des insectes aux pesticides est un sujet de préoccupation majeure de la recherche : la résistance aux pyréthrinoïdes d'Helicoverpa armigera sur cotonnier en est une illustration. Il est primordial d'assurer un suivi en laboratoire et sur le terrain grâce à un réseau international : c'est le cas en Afrique de l'Ouest et du Centre. Les mécanismes mis en cause sont à l'étude. La collaboration entre plusieurs pays et plusieurs filières (par exemple coton et maraîchage), ainsi que le concours de différents services nationaux sont indispensables à la mise en place d'une protection intégrée des cultures.