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Les séquences répétées du bananier : Comment les compter?

Baurens F.C., Carreel F., Noyer J.L., Lagoda P.. 1996. In : Méribel 1995. s.l. : s.n., p. 77-86. Réunion sur les Marqueurs Moléculaires chez les Végétaux, 1995-03-20/1995-03-24, Méribel (France).

Dans une optique générale d'étude des séquences répétées chez le bananier, les recherches se sont portées tout d'abord vers l'identification de séquences spécifiques et si possible, dispersées, du génome A et du génome B. De par leur nombre et leurs localisations, ces séquences se prêtent bien à l'utilisation de la PCR en tant qu'outil spécifique d'identification. Le laboratoire a développé l'utilisation de la PCR couplée aux séquences répétées. pMACIR1115, une sonde identifiée par hybridation comme étant répétée, est capable par RFLP, de différencier les génomes A et B chez les bananiers tant sauvages que cultivés. Ce fragment d'ADN a été séquencé et la définition d'amorces a permis de reproduire le profil spécifique obtenu par hybridation. Par amplification PCR d'une région de la sonde, il a été obtenu un fragment chez les individus possédant des caractéristiques du génome A mais pas de fragment chez M. balbisiana. Malheureusement, il n'est pas possible grâce au crible présence/absence de fragment amplifié de différencier les différentes classes de triploïdes comme AAA, AAB, ABB. La mise en place d'une technique de PCR quantitative permettra d'augmenter le pouvoir discriminatoire de la sonde

Mots-clés : musa; génétique moléculaire; isoenzyme; rflp; adn; carte génétique; marqueur génétique; séquence nucléotidique

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