La sécheresse constitue le principal stress abiotique limitant la production et la stabilité des rendements chez le riz (Oryza sativa) tant pour le riz pluvial que pour celui produit en altitude. Les systèmes radiculaires jouent un rôle important en matière de résistance à la sécheresse. L'introduction de critères de sélection pour les racines en vue d'améliorer la résistance à la sécheresse est rendue difficile en raison de l'absence de techniques de sélection efficaces et fiables. À l'aide d'un dispositif à deux couches (cire-pétrole) simulant des couches de sol compactées, certaines caractéristiques des racines ont été évaluées chez une population de lignées haploïdes doublées (HD) dérivées d'un croisement entre 'IR64' et 'Azucena'. Douze possibles QTL (" quantitative trait loci ") ont été détectés par cartographie d'intervalles. Ceux-ci comprenaient quatre QTL pour l'aptitude à pénétrer, quatre pour l'épaisseur des racines, deux pour le nombre de racines pénétrées et deux pour le nombre total de racines. Entre 8,4 % et 16,4 % de la variation phénotypique pouvait être attribuée à ces QTL individuellement. Aucun QTL n'a été détecté par cartographie d'intervalles pour la longueur maximale de pénétration racinaire. Un QTL localisé entre RG104 et RG348 affectait à la fois l'aptitude à la pénétration et l'épaisseur des racines. Les QTL pour l'aptitude à pénétrer et pour l'épaisseur ont été comparés chez deux populations ('IR64'-'Azucena' et 'C039'-'Moroberekan') dans diverses conditions. Les QTL reproductibles pourraient être employés pour la sélection assistée de racines profondes et épaisses ayant une grande aptitude à la pénétration du sol.