Un projet sur la génétique des composés biochimiques impliqués dans la qualité à la tasse du café a été initié à l'IRD (ex ORSTOM) en 1994. Les principaux composés étudiés sont: le saccharose, les acides chlorogéniques (ACG), la caféine et la trigonelline. L'analyse a été faite sur la descendance d'un croisement interspécifique entre C. pseudozanguebariae (PSE) et C. liberica var. dewevrei (DEW). PSE est une espèce sauvage possédant une courte période de maturation des graines (2 mois et demi). Elle diffère de DEW pour la composition biochimique de ces graines en ce qui concerne les composés liés à la qualité du café-boisson. Si l'on ne trouve pas de caféine et si la teneur en ACG y est faible, en revanche, les teneurs en sucres et en trigonelline sont élevées. L'impact relatif du milieu et des gènes a été montré par génétique quantitative. Une carte génétique AFLP a été obtenue en utilisant le croisement (PSExDEW)xDEW et des QTLs ont été localisés pour les teneurs en caféine, en ACG et en trigonelline. Actuellement, le projet s'intéresse particulièrement aux ACG et à la caféine, tous deux impliqués dans l'amertume du café-boisson. Un nouveau croisement entre PSE et C. canephora (CAN), fort producteur de caféine et d'ACG, est en cours de cartographie. Une évaluation biochimique est également commencée. Deux banques d'ADNc ont été obtenues à partir de feuilles de CAN et de graines récoltées à différents stades de maturation. Les gènes impliqués dans le contrôle de la teneur en caféine et ACG sont recherchés. La première approche utilisée consiste à trouver des séquences hétérologues équivalentes pour définir des amorces spécifiques déduites des domaines conservés de ces gènes. Les fragments correspondants seront amplifiés et utilisés comme sondes pour trouver une correspondance possible avec des QTLs. Si une telle co-localisation est trouvée, les gènes correspondants seront isolés et caractérisés. Une autre approche envisagée consiste à utiliser une double comparaiso