L'écologie a un rôle à jouer dans la nouvelle problématique mondiale qui oppose la protection sanitaire des marchés de l'élevage, la conservation de la biodiversité et les maladies transmissibles qui persistent, apparaissent ou ré-apparaissent. Alors que les connaissances classiques sur les maladies transmissibles s'accumulent, il est temps d'aborder leurs relations avec l'écologie. C'est l'objet de ce mémoire. Le premier chapitre examine la place des maladies transmissibles dans la dynamique des populations et leur importance dans les domaines de la conservation et de la gestion de la faune sauvage. Il est suggéré que l'écologie est indispensable pour comprendre et résoudre les problèmes posés par ces maladies. Que faut-il faire pour préserver la santé des hommes, de leurs espèces domestiques et des espèces sauvages quand on parle de gestion de la faune ? Le second chapitre explore à travers l'exemple de la tuberculose bovine comment la lutte contre une maladie contagieuse a été entreprise dans trois situations politiques et géographiques différentes (le Royaume-Uni, la Nouvelle-Zélande et le Kruger National Park en Afrique du Sud). Ce chapitre présente aussi les échecs du passé souvent causés par une approche scientifique insuffisante et les options futures dépendantes d'une meilleure connaissance écologique et épidémiologique. Ainsi, cette synthèse expose la coordination scientifique et pluridisciplinaire nécessaire à la résolution des problèmes liés aux maladies transmissibles dans un contexte complexe où les conséquences de nos actions sur l'environnement ne sont pas toujours prévisibles.