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Méthylation de l'ADN génomique et variations épigénétiques chez les végétaux : le cas de l'anomalie florale "mantled" chez le palmier à huile = DNA methylation and epigenetic variation in plants: the "mantled" floral abnormality of oil palm as a case study

Jaligot E.. 2003. Montpellier : UM2, 151-[46] p.. Thèse de doctorat: Physiologie végétale.

Un important déficit en méthylation de l'ADN a été démontré précédemment dans différents tissus provenant de palmiers à huile (Elaeis guineensis Jacq.) issus de l'embryogenèse somatique et manifestant la variation somaclonale "mantled". Au cours de la présente étude, nous avons, dans un premier temps, cherché à confirmer l'association entre hypométhylation et anomalie phénotypique en induisant une déméthylation du génome au moyen de substances chimiques utilisées en cancérologie (5-azacytidine, 5-aza-2'-désoxycytidine, S-adénosylméthionine). Nous avons également porté nos investigations à une échelle plus fine, en ciblant des séquences spécifiques, dont les perturbations des profils de méthylation sont susceptibles de rendre compte du phénotype variant. Pour cela, deux techniques différentes de recherche de marqueurs moléculaires, basées sur des différentiels de profils de méthylation au niveau de sites Mspl/Hpall, ont été mises en oeuvre. Nous avons ainsi criblé des sondes ADNc de palmier à huile sur leur capacité à discriminer entre les deux phénotypes de cals embryogènes, par methylation-sensitive-RFLP/Southern blot (MS-RFLP). Chez une population de régénérants adultes des deux phénotypes, nous avons effectué une comparaison à grande échelle du statut de méthylation des sites CCGG, par methylation-sensitive amplification polymorphism (MSAP). Puis, afin de cartographier plus finement le statut de méthylation des différents marqueurs d'intérêt ainsi mis en évidence, nous avons entrepris de mettre au point la réaction de conversion des cytosines non méthylées par le bisulfite de sodium. Les dysfonctionnements des gènes d'ADN-méthyltransférases sont fréquemment impliqués dans l'apparition d'anomalies du développement. Dans le but d'examiner la possible implication de ces gènes dans le phénotype variant, nous avons cherché à isoler des représentants de la principale famille structurale, METI, chez le palmier à huile. Les différentes approches développées au cours de cette thèse sont susceptibles de converger vers l'élaboration d'un test de détection précoce de la variation somaclonale "mantled". (Résumé d'auteur)

Mots-clés : elaeis guineensis; embryogenese somatique; variation somaclonale; methylation; adn; variant; trouble de differenciation sexuelle; inflorescence; marqueur genetique; sonde nucleique; epigenetique

Thématique : Génétique et amélioration des plantes; Multiplication végétative des plantes

Thèse

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