Publications des agents du Cirad

Cirad

Mapping quantitative trait loci for bean traits and ovule number in Theobroma cacao L.

Clément D., Risterucci A.M., Motamayor J.C., N'Goran J.A.K., Lanaud C.. 2003. Genome (Ottawa), 46 (1) : p. 103-111.

DOI: 10.1139/g02-118

La cartographie de locus à caractère quantitatif (QTL) pour des caractéristiques de fèves et pour le nombre d'ovules par ovaire a été réalisée chez le cacaoyer (Theobroma cacao L.) à partir de trois descendances de type test-cross provenant de croisements entre un parent mâle Forastero bas Amazonien (Catongo) et trois parents femelles: un Forastero haut Amazonien (IMC78) et deux Trinitario (DR1 et S52). Des marqueurs RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism), microsatellite et AFLP (Amplification Fragment Length Polymorphism) ont été utilisés pour la cartographie. Un à six QTL pour des caractères de fèves (longueur, poids et index de forme) et un à quatre QTL pour le nombre d'ovules par ovaire ont été détectés par "composite interval mapping". Ces QTL expliquaient de 5 à 24% de la variation phénotypique. Des groupes de QTL ont été identifiés sur plusieurs chromosomes, mais plus particulièrement sur le chromosome 4. Les QTL impliqués dans les caractères de fèves ont été détectés dans la même région chez les deux Trinitario et dans une région proche chez le Forastero haut Amazonien. A partir d'une étude de diversité, où les allèles spécifiques de génotypes Criollo et Forastero ont été identifiés, il a été possible de déterminer l'origine putative (Criollo ou Forastero) des allèles favorables aux QTL en ségrégation chez les deux Trinitario étudiés.

Mots-clés : theobroma cacao; marqueur génétique; rflp; microsatellite; carte génétique; fève de cacao; ovule; variation génétique; qtl

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