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Cirad

Search for methylation-sensitive amplification polymorphisms associated with the "mantled" variant phenotype in oil palm (Elaeis guineensis Jacq.)

Jaligot E., Beulé T., Baurens F.C., Billotte N., Rival A.. 2004. Genome (Ottawa), 47 (1) : p. 224-228.

DOI: 10.1139/g03-085

La technique de polymorphisme d'amplification sensible à la méthylation (" methylation-sensitive amplification polymorphism " (MSAP)) a été utilisée sur des palmiers à huile (Elaeis guineensis Jacq.) provenant d'embryons somatiques, dans le but d'identifier des polymorphismes de méthylation liés à la variation somaclonale " mantled ". Ce phénotype variant présente une féminisation instable des organes mâles sur les fleurs des deux sexes. Par MSAP, le statut de méthylation des sites CCGG a été comparé dans quatre descendances clonales composées de trois régénérants de chaque phénotype (normal et " mantled "), provenant de quatre plantes-mères génotypiquement distinctes. Un total de 64 amorces d'amplification sélectives a été employé et a révélé 23 marqueurs présentant un profil de méthylation spécifique du phénotype. Chacun de ces 23 marqueurs n'a montré de polymorphisme lié au phénotype qu'au sein de la même origine génétique. Ce résultat empêche pour l'instant l'utilisation de marqueurs MSAP pour la détection précoce de variants, mais la caractérisation prochaine de ces marqueurs fournira des informations très utiles sur de potentielles séquences cibles.

Mots-clés : elaeis guineensis; variation somaclonale; méthylation; adn; variant; polymorphisme biochimique; marqueur génétique; trouble génétique; fleur

Article (a-revue à facteur d'impact)

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