La mise en place des CTE à la Réunion et en Guadeloupe a fait l'objet d'un projet de recherche dans le cadre du dispositif Inra-Cirad-Cemagref. Les résultats ont permis de montrer que les systèmes d'action différents des deux îles se traduisent par des modes d'appropriation et des pratiques d'utilisation des instruments de politique publique distinctes. La prise en compte du territoire, pourtant privilégié par la LOA, a été faible et différenciée dans les deux situations. Considérant ce dernier comme un espace de régulation important au regard d'une politique agricole multifonctionnelle, nous discutons de la nécessité de définir des situations de gestion, des territoires-projets et des territoires d'action au regard des enjeux environnementaux et des espaces d'activités des acteurs, des dispositifs de gouvernance existants et en fonction de l'état de définition du projet de développement agricole au niveau régional. Nous analysons ainsi les différents niveaux de territorialisation des politiques publiques agricoles nationales à visée multifonctionnelle: l'espace domien, la Région et les territoires-projets. Nous concluons ainsi que les liens entre territorialisation de politiques publiques à portée multifonctionnelle, développement régional et dynamiques territoriales.