Se estudió la diversidad genética presente en los cafés silvestres y cultivados por los marcadores moleculares RAPD (ADN polimorfico amplificado al azar), con el objetivo de revelar la estructura y poder utilizarla para el mejoramiento genético regional. El material analizado se constituyó de 117 individuos representando por 88 accesiones silvestres de Etiopía, 6 variedades cultivadas localmente en Etiopía y 12 variedades derivadas de las bases genéticas Typica y Bourbon que dieron origen al desarrollo del cultivo del café en el continente americano y el Caribe, en el siglo XVIII. Los resultados confirman que dos bases genéticas distintas fueron difundidas a partir de Holanda y Francia, y luego a partir de la isla Bourbon (ahora Reunión), las cuales presentan un bajo nivel de diversidad genética y de polimorfismo. Casi la totalidad de la diversidad genética fue detectada en los individuos silvestres (28 de los 29 marcadores utilizados), lo que demuestra el valor de estos materiales para enriquecer la base genética del material cultivado. El material silvestre se clasificó en relación con el origen geográfico, correspondiendo ala separación que hace la fosa tectónica ("The Great Rift Valley") en Etiopía. Las variedades de Etiopía mostraron una diversidad genética comparable ala de los individuos silvestres. Los marcadores RAPD fueron eficientes para distinguir las variedades del Typica y del Bourbon. Sin embargo, no detectaron diferencias dentro de cada base genética, y tampoco dentro de las accesiones silvestres, excepto en dos accesiones que tienen plantas no conformes a su identificación en el germoplasma del CATIE.