Un référentiel des principales contraintes sanitaires dans les élevages bovins laitiers, allaitants et engraisseurs, a été établi par le CIRAD-EMVT en 1996 en collaboration étroiteavec les filières de production, l'Etablissement Départemental de l'Elevage, le Groupement de Défense Sanitaire, les Services Vétérinaires, et les vétérinaires praticiens. Il s'agissait alors d'établir la situation épidémiologique des principales affections bovines, en mettant l'accent sur les maladies infectieuses, mais également sur les pathologies liées aux conditions d'élevage (hygiène de la traite, du vêlage, alimentation, stress et environnement), les plus fréquentes, dont l'expression clinique frustre et rarement mortelle amène souvent à sous-estimer les pertes zootechniques et économiques qu'elles engendrent. En élevages laitiers, mammites, métrites, rétentions placentaire, boiteries, difficultés de vêlages et infertilité sont les troubles les plus fréquemment observés. La période du post-partum constitue une phase de sensibilité particulière aux infections: 30 et 46% des mammites et des métrites respectivement surviennent pendant le premier mois de lactation. Ce constat, associé à une fréquence élevée des troubles du vêlage et des mammites pour le 1er rang de lactation devrait conduire les éleveurs à une attention toute particulière à l'hygiène du 1er vêlage et de la traite dans les premiers jours de lactation. Les hémoparasitoses constituent la pathologie tropicale la plus fréquente avec 7% des lactations atteintes. En élevages allaitants, les troubles de la reproduction constituent plus de la moitié des cas de pathologie rencontrés chez les mères. L'infertilité est fréquente: 48% des intervalles vêlage-vêlage sont supérieurs à 365 jours. Chez les veaux, les atteintes digestives, les défauts de croissance et la mortinatalité sont les principales dominantes. Ces animaux sont aussi les plus fréquemment touchés par le parasitisme digestif. Chez les bovins à l'engrais, les troubles r