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Diversité, origine et dynamique évolutive des ignames cultivées Dioscorea rotundata Poir. au Bénin

Tostain S., Chaïr H., Scarcelli N., Noyer J.L., Agbangla C., Marchand J.L., Pham J.L.. 2005. In : Un dialogue pour la diversité génétique : 5e Colloque National BRG - ISARA, Lyon, 3-4-5 novembre 2004. Paris : BRG, p. 465-482. (Les Actes du BRG, 5). Colloque national BRG Dialogue pour la diversité génétique. 5, 2004-11-03/2004-11-05, Lyon (France).

Les objectifs de l'étude ont été 1) d'évaluer la diversité des cultivars et des ignames sauvages apparentées au Bénin, 2) d'étudier les relations génétiques entre cultivars et les relations entre cultivars et ignames sauvages et 3) de déterminer l'origine génétique des ignames en cours d'ennoblissement en estimant l'impact des pratiques de domestication. Plus de 400 accessions de cultivars, D. rotundata Poir. et d'ignames sauvages apparentées D. abyssinica et D. praehensilis ont été collectées au Bénin et analysées à l'aide de différents types de marqueurs: AFLP, microsatellites nucléaires et chloroplastiques. Les deux espèces sauvages ancêtres des cultivars sont génétiquement différenciées sur la base des marqueurs moléculaires, y compris en situation de sympatrie, suggérant ainsi que les flux de gènes sont très réduits. L'étude des cultivars montre une structuration géographique et une structuration suivant le nombre de tubérisations (une ou deux). Les trois espèces ont le même haplotype chloroplastique à l'exception de trois accessions de D. abyssinica. Le processus de domestication chez les ignames africaines aurait abouti à une forte divergence des gènes nucléaires mais pas des gènes chloroplastiques. Environ 47% des ignames prédomestiquées sont de type cultivé et 53% de type sauvage ou intermédiaire. Certains cultivars ont présenté des génotypes AFLP de type sauvage. L'utilisation par certains paysans des produits de la reproduction sexuée dans les compartiments sauvage et cultivé est ainsi confirmée. (Résumé d'auteur)

Mots-clés : dioscorea rotundata; variété; biodiversité; Évolution; marqueur génétique; bénin

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