Des séquences virales de Banana streak virus (BSV) sont intégrées dans le génome des bananiers. Certaines de ces séquences endogènes BSV, nommées endogenous pararetrovirus EPRV, limitées au chromosome de l'espèce Musa balbisiana (noté B) sont à l'origine de particules virales infectieuses après des stress biotiques et abiotiques comme ceux résultant de croisements génétiques interspécifiques. L'analyse génétique de l'incidence du BSV sur une population FI triploïde (AAB) issue du croisement interspécifique entre des parents sains diploïde M. balbisiana (BB) et tétraploïde M. acuminata (AAAA) montre une ségrégation mendélienne de l'expression de la maladie puisque la moitié de la descendance présente des particules virales de type BSV. Une analyse PCR du croisement utilisant des amorces spécifique du BSV a montré que les EPRV BSV étaient restreintes au seul génome M. balbisiana. Des marqueurs moléculaires liés à la présence ou à l'absence de virus épisomal ont été recherchés. Dix marqueurs AFLP polymorphes reliés au parent B ont été isolés: 7 sont corrélés à l'expression du virus épisomal et 3 au phénotype "absence de virions". Tous ces marqueurs AFLP ne sont restreints qu'au génome B. L'analyse de leur ségrégation a permis d'établir une carte génétique du locus impliqué dans l'expression du virus pour le parent femelle (BB). Ce locus est appelé locus BEL pour "BSV expressed locus". L'hypothèse d'un système allélique monogénique de l'expression virale est avancée donnant au parent femelle BB le rôle de porteur sain. Rien n'est connu des mécanismes sous-jacents à l'expression du virus à partir d'EPRV pathogènes ni à leurs régulations et le possible rôle de la méthylation des gènes a été envisagé. Un différentiel de méthylation de la cytosine a été recherché par la technique de SD-AFLP/MSAP entre les hybrides sains et infectés de la population F1. Parmi les 30 fragments ADN retenus par SD-AFLP/MSAP, un seul correspond à un marqueur AFLP situé à proximité du locus BEL.