Grâce à un financement du Fonds de Coopération Régionale de la Collectivité de Mayotte, une prospection a été réalisée visant à identifier les contraintes phytosanitaires prévalant dans les plantations de l'archipel des Comores (Figure 1). L'enquête a été réalisée à Mayotte, Grande Comore et Moheli entre le 23 avril et le 7 mai 2007, en collaboration avec la Chambre d'Agriculture, de la Pêche et de l'Aquaculture à Mayotte et le GIE "Maison des Epices" dans l'Union des Comores. L'île d'Anjouan n'a pu être prospectée comme prévu, en raison des tensions politiques qui n'ont cessé de prévaloir depuis mai 2007. Ce compte-rendu fait suite au rapport intermédiaire rédigé en juin 2007. II rappelle quelques éléments sur la diversité et la pathologie des vanilliers dans l'Océan Indien, présente les résultats des analyses effectuées sur les échantillons collectés au cours de la prospection et formule des recommandations techniques pour la gestion des ressources génétiques et des bio-agresseurs des vanilliers de l'archipel.