De par le monde, les cocotiers (Cocos nucifera L.) sont affectés par divers type de jaunissements mortels (JM). Certains de ces syndromes sont causés par des phytoplasmes, petites bactéries impossibles à détecter en microscopie optique. L'amplification d'un gène donné des phytoplasmes par Polymerase Chain Reaction (PCR) est le moyen le plus commode de faire le diagnostic. Le problème, c'est qu'il y a au moins 28 " groupes " de phytoplasmes et une seule paire d'amorces -P1/P7- fréquemment utilisée pour la PCR. Comme ces séquences appartiennent à un gène très conservé, les faux positifs sont fréquents. Il faut donc également utiliser d'autres amorces spécifiques d'une "souche" (ou sous-groupe) - par exemple, LY-F/LY-R pour le JM des Caraïbes, les amorces de Rohde pour la " LD Tanzania ". De telles amorces spécifiques sont parfois restrictives. En effet il existe une variabilité au sein de chaque souche et les séquences des amorces doivent être adaptées à cette variabilité. On connaît à ce jour au moins 5 sous-groupes de JM. Ces sous-groupes sont identifiables par RFLP ou séquençage. En Afrique deux sous-groupes de phytoplasmes associés à des JM ont été identifies.