Les travaux de recherche décrits dans ce mémoire ont été réalisés à la station de Pathologie Végétale du centre INRA Bordeaux-Aquitaine d'octobre 1987 à février 1992, dans le cadre de mon DEA et de ma thèse de Doctorat, puis dans celui des postes que j'ai successivement occupés au Queensland Agricultural Biotechnology Centre (QABC) du Queensland Department on Primary Industries (QDPI) de Brisbane (Australie) de mars 1992 à juin 1995, à l'Institute of Molecular Plant Sciences de la Rijksuniversiteit de Leiden (Pays-Bas) d'août 1995 à décembre 1997, au Laboratoire de Biologie Cellulaire du centre INRA de Versailles, de janvier 1998 à mai 2001 et de celui que j'occupe depuis octobre 2001 à la station de Neufchâteau du CIRAD Guadeloupe. Ces travaux ont porté sur l'analyse, la fonction et la diversité des génomes viraux chez les plantes à des fins de mise au point de stratégies de lutte anti-virale. Ils ont eu pour objets des virus appartenant à quatre grandes familles de virus (Potyviridae, Bromoviridae, Flexiviridae et Caulimoviridae) dont les génomes ont des organisations et des stratégies d'expression différentes. Dans le cadre de mes activités de recherche, j'ai déterminé la séquence nucléotidique totale ou partielle de l'ARN génomique de trois potyvirus infectant les arbres fruitiers du genre Prunus (Plum pox virus, PPV) ou l'arachide (Peanut stripe virus, PStV et Peanut mottle virus, PeMoV), ainsi que celle d'un flexivirus infectant le bananier que nous avons identifié (Banana virus X, BVX). Ces travaux avaient pour objectif d'élucider l'organisation du génome de ces virus et d'attribuer, sur la base d'homologies de séquences, des fonctions aux protéines correspondantes. Certaines de ces séquences ont été utilisées pour des études de diversité moléculaire, de même que des séquences partielles d'un autre flexivirus infectant le bananier, le Banana mild mosaic virus (BanMMV). Dans ce dernier cas, nos travaux ont montré que les populations virales étudiées présentent