La pourriture brune, causée par les Phytophthora spp, est la plus importante maladie du cacaoyer dans les pays producteurs. Quoique l'usage de pesticides soit efficace dans le contrôle de cette maladie, la résistance a été l'objet de beaucoup d'attention, à cause de son coût réduit pour les produceurs, et car elle ne présent pas des problèmes écologiques. La création de variétés résistantes, par contre, peut être plus rapide et efficace si elle est assistée par des marqueurs moléculaires. Dans ce projet, une population F1 du croisement TSH-1188 x CCN-51, avec 282 individus, est en train d'être caractérisée moléculairement et phénotypiquement pour les caractères associés à la production et à la résistance à la pourriture brune. Pour évaluer la résistance à la pourriture brune, la méthode des disques de feuilles a été employée, en inoculant les 282 plantes de la descendance, les parents (CCN-51 et TSH-1188) et deux témoins (Catongo et Sca-6), avec une suspension de 3 x 105 zoospores des espèces P. palmivora et P. citrophthora. Pour chaque génotype, 20 disques ont été inoculés, en quatre répétitions (blocs), avec cinq disques par bloc. Cinq jours après l'inoculation, chaque disque de feuille inoculé a été évalué, en accord avec une échelle à cinq notes (1 à 5). On a pu vérifier que les parents des descendances sont statistiquement plus résistants que le témoin susceptible (Catongo), mais moins résistants que le témoin résistant (Sca-6). Quoique les parents n'étaient pas différents statistiquement entre eux, quant à la résistance, pour chacune des espèces de Phytophthora, la descendance F1 a ségrégué, pour cette propriété, en montrant ainsi son adéquation pour la cartographie génétique de la résistance. Nous avons pu observer un rapport linéaire positif entre les mesures de sévérité causées par les deux espèces de Phytophthora sur la descendance F1 (r = 0.83**); mais l'interaction descendancee x espèce de Phytophthora a été largement significative, par le test F.