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Genetic identification and characterisation of new microsatellite markers derived from expressed tag sequences (est) in Theobroma cacao L.

Lanaud C., Argout X., Fouet O., Jeanneau M., Loor R.G., N'Goran J.A.K., Lemainque A., Legavre T., Sabau X., Wincker P., Da Silva C., Gramacho K.P., Risterucci A.M.. 2010. In : 15th International Cocoa Research Conference : cocoa productivity, quality, profitability, human health and the environment. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, p. 519-523. Conférence internationale sur la recherche cacaoyère. 15, 2006-10-09/2006-10-14, San José (Costa Rica).

Plusieurs centaines de nouveaux marqueurs microsatellites (SSR) ont été identifiés dans des séquences d'ADNc produites après le séquençage de plusieurs bibliothèques d'ADNc établies par le CIRAD dans le cadre du projet GENOSCOPE. Après annotation des séquences d'ADNc, il a été possible d'identifier des marqueurs microsatellites dans des gènes de cacao homologues à une fonction connue des gènes et potentiellement impliqués dans des caractères intéressants pour la sélection du cacao, comme des gènes de défense ou de résistance, des facteurs de transcription, des gènes impliqués dans les voies métaboliques importantes pour les caractères de qualité du cacao, etc. Cent cinquante nouveaux microsatellites dérivés de séquences EST ont été cartographiés dans la carte de référence, fournissant une nouvelle carte avec 615 marqueurs codominants. La cartographie de tels gènes candidats pourrait permettre d'obtenir une meilleure connaissance des mécanismes génétiques et moléculaires qui sous-tendent les caractères intéressants dans T. cacao.

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