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Rôle du système de sécrétion de type III SPI-1 et des mégaenzymes NRPS dans le cycle de vie de Xanthomonas albilineans, agent causal de l'échaudure des feuilles de la canne à sucre

Marguerettaz M.. 2010. Montpellier : UM2, 295 p.. Thèse de doctorat -- Biologie intégrative des plantes.

Xanthomonas albilineans est l'agent causal de l'échaudure des feuilles de la canne à sucre. Peu d'éléments sont connus sur les bases moléculaires de l'invasion du xylème de la canne à sucre par cette bactérie. Nous manquons également d'informations sur l'écologie de X albilineans qui, dans certaines zones de culture et dans des conditions climatiques particulières, est capable d'infecter la canne à sucre par voie aérienne. La découverte récente dans le génome de X albilineans de clusters de gènes spécifiques à cette espèce ouvre de nouvelles perspectives. Bien qu'aucune association de X albilineans avec un hôte animal n'ait été décrite à ce jour, cette bactérie possède un système de sécrétion de type III SPI-1 ("Salmonella Pathogenicity Island-1"). Nous avons montré que ce système n'est pas indispensable à la multiplication de X albilineans in planta. Des analyses de phylogénie, de recombinaison et de sélection de ce système au sein de souches représentatives de la diversité de X albilineans permettent de proposer de nouvelles hypothèses sur l'écologie de cette bactérie.X. albilineans possède aussi plusieurs clusters de gènes NRPS ("NonRibosomal Peptide Synthetase"), dont l'un est impliqué dans la biosynthèse de l'albicidine, une phytotoxine responsable de l'apparition de symptômes foliaires. Des analyses in silico ont permis de montrer que les autres clusters de gènes NRPS de X albilineans sont impliqués dans la biosynthèse et la sécrétion de nouvelles petites molécules. Le rôle de ces molécules reste inconnu mais, d'après l'analyse fonctionnelle des NRPS de X albilineans, au moins une de ces molécules influence la multiplication de la bactérie in planta.

Mots-clés : saccharum officinarum; xanthomonas albilineans; activité enzymatique; relation hôte pathogène; pseudomonas pseudomallei; xanthomonas oryzae; échaudure; albicidine; Échaudure des feuilles

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