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Résistance de la canne à sucre à la maladie de la feuille jaune et à son vecteur Melanaphis sacchari : association marqueur-trait dans une population de cultivars, mécanismes de résistance au vecteur et diversité génétique du vecteur

Fartek B.. 2011. Saint-Denis : Université de la Réunion, 173 p.. Thèse de doctorat -- Biologie végétale.

La maladie de la feuille jaune peut entraîner d'importantes pertes de rendement chez la canne à sucre. Elle est causée par le Sugarcane yellow leaf virus (SCYLV, genre : Polerovirus, famille : Luteoviridae), qui est principalement transmis par le puceron Melanaphis sacchari (Zehntner) (Hemiptera : Aphididae). La résistance variétale étant le principal moyen de lutte contre les maladies virales, la caractérisation de sources de résistances efficaces et durables à la maladie de la feuille jaune est un enjeu majeur pour l'amélioration variétale de la canne à sucre. Au cours de cette thèse, la caractérisation la résistance à la maladie de la feuille jaune a été entreprise sous trois angles : i/ l'identification de marqueurs moléculaires associés à la résistance au SCYLV et à Melanaphis sacchari au sein du germplasm cultivé ii/ la caractérisation fine des mécanismes de résistance à M. sacchari chez le cultivar R 365 et iii/ l'évaluation de la diversité génétique des populations de Melanaphis spp. présentes sur la canne à sucre et sur Sorghum spp. L'identification de marqueurs associés à la résistance à la maladie de la feuille jaune a été réalisée par une approche d'association mapping menée sur deux panels de cultivars à la Réunion et en Guadeloupe. Ces deux panels ont été génotypés en utilisant les technologies AFLP et DArT. Leur phénotypage a été réalisé en conditions d'infestation naturelles. Ces travaux ont permis d'identifier 45 haplotypes significativement associés à la résistance à la maladie de la feuille jaune ou à son vecteur. Cinq des haplotypes associés à la réduction de l'incidence du virus ont été co-détectés dans les deux panels de cultivars. Trois haplotypes regroupent des marqueurs associés à la fois à l'incidence du vecteur et à celle du virus. La caractérisation de la résistance à Melanaphis sacchari chez le cultivar R 365 nous a permis de mettre en évidence un effet d'antixénose et un effet d'antibiose. L'étude du comportement alimentaire du puceron

Mots-clés : saccharum officinarum; sorghum; melanaphis; résistance aux organismes nuisibles; résistance aux maladies; virus des végétaux; variété; marqueur génétique; génotype; taxonomie; variation génétique; carte génétique; la réunion; guadeloupe; france; sugarcane yellow leaf virus; séquencage; melanaphis sacchari

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