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Emergence mondiale de la maladie des raies noires du bananier : histoire de l'invasion et stratégie de vie du champignon phytopathogène Mycosphaerella fijiensis

Robert S.. 2012. Montpellier : UM2, 240 p.. Thèse de doctorat -- Evolution, Ecologie, Ressources génétiques , Paléontologie.

La compréhension des mécanismes écologiques et évolutifs sous-tendant l'émergence des maladies de plantes cultivées est un enjeu majeur, ancré dans la problématique générale des invasions biologiques. Nous l'abordons ici via l'étude du champignon phytopathogène Mycosphaerella fijiensis, responsable de la récente pandémie de maladie des raies noires du bananier. Une étude de la structure génétique mondiale à différents marqueurs neutres confirme l'aire d'origine sud-est asiatique de M. fijiensis, et suggère des scénarios d'invasion contrastés entre continents. L'invasion africaine découlerait ainsi d'un évènement de fondation unique tandis que l'invasion de l'Amérique dériverait d'un mélange de différentes sources. Utilisant des méthodes d'analyse récentes (ABC " Approximate Bayesian Computation "), nous vérifions la pertinence de ces deux scénarios dans un cadre statistique et estimons des paramètres démographiques, qui suggèrent que la dissémination continentale s'est accompagnée de goulots d'étranglement drastiques. Par ailleurs, nous explorons les fondements du succès compétitif de M. fijiensis, qui a systématiquement supplanté l'espèce proche M. musicola précédemment établie, à l'aide d'une comparaison expérimentale des stratégies de vie des deux espèces. Notre étude suggère une importance cruciale et sousestimée de la reproduction asexuée dans le succès de M. fijiensis et soulève des questions fondamentales dans le cadre de la théorie de l'évolution des histoires de vie. Nos travaux illustrent enfin l'intérêt d'une approche multidisciplinaire à visée fondamentale pour l'optimisation des stratégies de prévention et de lutte. (Résumé d'auteur)

Mots-clés : maladie des raies noires; espèce envahissante; génétique des populations; dynamique des populations; Épidémiologie; maladie fongique; musa; mycosphaerella musicola; mycosphaerella fijiensis; asie du sud-est; amériques; afrique; Émergence

Thématique : Génétique et amélioration des plantes; Maladies des plantes

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