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Etude des différents niveaux de régulation du stress oxydatif chez Hevea brasiliensis : implication des micro-ARNs

Gebelin V.. 2012. Montpellier : UM2, 200 p.. Thèse de doctorat -- Biologie intégrative des plantes.

Hevea brasiliensis est cultivé pour le caoutchouc naturel contenu dans le latex. Une exploitation intensive combinée aux stress environnementaux affectent la production de latex. Le Tapping Panel Dryness (TPD), désordre physiologique complexe, est responsable d'une perte annuelle de production de 10 a 40%. Le stress oxydatif, point de départ de la maladie, affecte aussi bien l'écoulement, par la coagulation in situ du latex, que la régénération du contenu cellulaire entre deux saignées. Chez les plantes, la réponse adaptative aux stress abiotiques dépend de la finesse de la régulation de l'expression des gènes. Ce contrôle se fait au niveau transcriptionnel mais également au niveau post-transcriptionnel. Les micro-ARNs jouent un rôle crucial en menant les ARNs messagers cibles à la dégradation ou au blocage de leur traduction. L'objectif de cette thèse est de comprendre et d'identifier les différents niveaux de régulation du stress oxydatif en étudiant l'implication des micro-ARNs dans la régulation des stress abiotiques et du TPD chez l'hévéa. L'isolation et le séquençage haut débit de petits-ARNs a permis l'identification de micro-ARNs d'hévéa. Dans un premier temps, une banque de petits ARNs a été effectuée a partir de vitroplants soumis ou non à des stress abiotiques, à laquelle se sont ajoutées dans un second temps, deux banques fabriquées a partir de latex d'arbres en exploitation atteints ou non par le TPD. L'analyse de la population de petits ARNs montre une diminution de la taille des séquences en réponse a la maladie, la majorité des séquences de petits ARNs de latex étant de 21 nucléotides chez les arbres malades et 24 nucléotides chez les arbres sains. En combinant le pipeline d'analyse bioinformatique LeARN et les données transcriptomiques, soixante huit familles de micro-ARNs conserves entre les espèces et quinze nouvelles familles de micro-ARNs ont été identifiées chez l'hévéa. Les gènes codant pour la voie de biogenèse des micro-ARNs sont présents da

Mots-clés : régulation physiologique; hevea brasiliensis; expression des gènes; arn; stress; oxydation; latex; récolte; physiologie végétale; rendement des cultures

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