La maladie de la pourriture brune des cabosses du cacaoyer est causée par plusieurs espèces de Phytophthora. En Afrique, l'espèce responsable est P. megakarya. Cette espèce est la plus destructrice et concerne le premier continent producteur de cacao. Dans le cadre de ce travail, nous avons réalisé 12 croisements entre souches de P. megakarya provenant de différentes populations (2 Afrique de l'Ouest : Nigeria et 4 Afrique Centrale : Cameroun) afin d'obtenir des descendances. Pour chaque population, des souches de signe de compatibilité sexuelle A 1 et A2 ont été choisies. Les souches sélectionnées et croisées ont également des niveaux d'agressivité différente. Le principal objectif de l'obtention de ces descendances est d'établir une carte génétique de P. megakarya et de caractériser des marqueurs d'agressivité (Q1L). Une méthode permettant la germination des oospores de P. megakarya a été mise au point, ce qui n'avait jamais été réalisé auparavant. Nous avons obtenu le développement de souches hybrides à partir de la germination d'oospores pour 8 croisements. Le nombre de souches isolées par croisement est compris entre 3 1 et 97. Le meilleur croisement a été NGR20 (Nigeria, A 1 ) par Ml84 (Cameroun, A2) avec 97 souches développées. L'utilisation des marqueurs moléculaires RAPD a permis de confirmer le caractère hybride et d'éliminer les souches provenant d'oospores autofécondées. Dans le cas du croisement NGR20 x Ml84, seulement 4 souches " autofécondées " ont été éliminées. Les 93 souches hybrides de cette descendance ont été croisées avec des souches de référence pour leur signe de compatibilité sexuelle : 53 souches sont de signe Al et 40 souches de signe A2. Cela montre que des souches A2 peuvent être obtenues par reproduction sexuée avec une fréquence proche de celle des Al. Toutefois au Onneroun tontes les souches isolées actuellement sur cacaoyer sont de signe Al, et aucune de signe A2, ce qui est un argument pour penser que la reproduction sexuée de P. me