A perda de C com a conversão da vegetação natural em área de produção agrícola é influenciada pela zona climática, pela classe de solo e sua textura e a intensidade do preparo utilizada. O objetivo do trabalho foi avaliar o efeito da conversão do solo sob vegetação natural em área de produção agrícola no estoque de C total, o C orgânico particulado (COP), o C associado aos minerais (COAM) em ecossistemas contrastantes (Tropical e Subtropical). Este trabalho foi realizado em um Latossolo Vermelho (675 g kg-1 de argila) em Ponta Grossa, PR (PG) com 29 anos sob preparo convencional, em um Latossolo Vermelho Amarelo (490 g kg-1 de argila) em Lucas do Rio Verde - MT (LRV) com 8 anos sob preparo e em um Neossolo Quartzarênico (770 g kg-1 de areia) em Luiz Eduardo de Magalhães - BH (LEM) com 4 anos sob preparo. Em PG, o estoque no COAM (234,0 Mg ha-1) foi 2,1 e 5,8 vezes mais elevado do que em LRV (COAM = 108,1 Mg ha-1) e LEM (39,8 Mg ha-1), enquanto o estoque de C no COP foi semelhante entre os ecossistemas (24,0 Mg ha-1 em PG; 25,2 Mg COP ha-1 em LRV e 27,4 Mg ha-1 em LEM) embora as diferenças no material de origem sejam contratantes. A média do estoque de COP em PG foi de 9,3% do estoque total de C, enquanto essa fração foi responsável por 19% em LRV e 35% do estoque total de C em LEM até 1 m de profundidade. Comparativamente, mais COP poderia ser mineralizado no Latosolo Vermelho Amarelo (LRV) e no Neossolo Quartzarênico indicando que o impacto da conversão na fração de C lábil gera perdas espressivas na fertilidade química, fisica, biologica do solo. Em cada ecossistema o preparo resultou em uma taxa de perda anual na camada 0-40 cm de 0,88; 1,55 e 0,40 Mg C ha-1 ano-1, para PG, LRV e LEM, respectivamente. Essas perdas ocorrem em maior expressão no COP do que no COAM. Em ambiente subtropical o COP e o COAM diminuiram na camada 0-40 cm de 17,6 e 128,1 Mg C ha-1 na vegetação nativa para 7,8 e 112,5 Mg C ha-1, representando 55% e 12% de decréscimo devido ao preparo do so