O objetivo desse trabalho foi avaliar o efeito de diferentes usos do solo no conteúdo e estoque de C nas frações particulada (COP) e associada aos minerais (COAM) da MOS. Este trabalho foi realizado em um Latossolo Vermelho de textura muito argilosa (675 g kg-1) em Ponta Grossa, PR (PG) com 29 anos e outra em um Latossolo Vermelho Amarelo de textura argilosa (490 g kg-1) em Lucas do Rio Verde - MT (LRV) com 8 anos de manejo. Em cada situação (PG, LRV) os tratamentos consistiram de três modos de uso da terra: preparo convencional (PC), plantio direto (PD) e o solo sob vegetação nativa (VN) de floresta. As frações COP e COAM foram separadas pelo método da tamisação em via úmida em sete profundidades de amostragem (0-5; 5-10, 10-20; 20-40; 40-60; 60-80; 80-100 cm) e o conteúdo de C total de cada fração foi determinado por combustão seca. As frações COP e COAM foram afetadas pela conversão das terras e o PC gerou as maiores perdas de C na fração particulada. Em PG, na camada de 0-5 cm o PC resultou em uma perda de carbono orgânico de 45,7 g kg-1 sendo 37% na fração COP, indicando menor migração de C para a fração COAM. Em condição Subtropical na camada 0-40 cm o COP e o COAM diminuiram de 14,5 e 77,5 Mg C ha-1 na vegetação nativa para 6,0 e 61,5 Mg C ha-1 quando converteu para PC, representando 59% e 21% de decrescimo devido ao preparo do solo. O COP e o COAM apresentou, 86% (4,86 Mg C ha-1) e 20% (12,14 Mg C ha-1) respectivamente, mais C sob PD do que em PC. O ganho de C (17 Mg C ha-1) no Latossolo Vermelho na camada 0-20 cm, com a conversão em PD foi atribuído as duas frações, sendo 27% ao COP e 73% ao COAM. Em contraste com a região subtropical, o COP representou em média 19% do estoque total de C em relação ao Cerrado, e variou nos sistemas de plantio direto de 14% a 17% até 1 m de profundidade. Na camada 0-20 cm o COP e o COAM diminuiram de 15,3 e 35,4 Mg C ha-1 da VN para 7,5 e 27,3 Mg C ha-1 no PC, representando 51% e 23% de redução devido ao preparo. O COP e o C