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Marqueurs moléculaires utilisables en sélection chez la canne à sucre : cas de la résistance à la rouille brune

Costet L., Le Cunff L., Royaert S., Raboin L.M., Hervouet C., Toubi L., Telismart H., Garsmeur O., Rousselle Y., Pauquet J., Nibouche S., Glaszmann J.C., Hoarau J.Y., D'Hont A.. 2012. In : ARTAS ; AFCAS. La canne à sucre source de développement et d'innovation : Congrès sucrier ARTAS-AFCAS, 10-14 septembre 2012, Saint Denis, La Rénion et du 15 au 19 septembre 2012 à Maurice. s.l. : s.n., 10 p.. Congrès sucrier ARTAS-AFCAS, 2012-09-10/2012-09-14, Saint Gilles (Réunion).

Les cultivars modernes de canne à sucre (Saccharum spp., 2n=100 à 130) sont hautement polyploïdes, aneuploïdes et d'origine interspécifique. Un gène majeur (Bru1) conférant la résistance à la rouille brune, causée par le champignon Puccinia melanocephala, a été identifié chez le cultivar R570. Nous avons analysé 380 cultivars modernes et clones en cours de sélection, représentatifs de la diversité mondiale, à l'aide de 22 marqueurs moléculaires regroupés dans un segment de 8,2cM génétiquement lié à Bru1 chez R570. Nos résultats révèlent un fort déséquilibre de liaison dans la région autour de Bru1 et de fortes associations entre la plupart des marqueurs et la résistance à la rouille. Deux marqueurs PCR flanquant le segment portant Bru1 sont complètement associés et sont présents uniquement chez les clones résistants. Ces marqueurs constituent des marqueurs moléculaires diagnostics de Bru1. 86% des 194 clones de canne à sucre résistants possèdent les marqueurs diagnostics de Bru1, révélant que ce gène constitue la principale source de résistance à la rouille brune chez les cultivars modernes. Les marqueurs PCR diagnostics de Bru1 devraient être particulièrement utiles pour identifier des cultivars possédant des sources de résistance alternatives à Bru1 afin de diversifier la base génétique de la résistance à la rouille brune dans les programmes de sélection.

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