Durant les dernières décennies, la distribution géographique des maladies dues à agents infectieux s'est considérablement étendue. Les crises sanitaires résultantes ont été l'occasion d'une réflexion approfondie sur les causes et les circonstances d'apparition, de développement de ces pathogènes. Si l'influence des changements écologiques sur les risques d'épizootie/épidémie est manifeste, d'autres hypothèses ont été émises pour tenter d'expliquer la réémergence de ces maladies ainsi que la propagation de ces pathogènes dans des zones autrefois épargnées. Avec la mondialisation et par conséquent l'intensification du commerce international, les risques, en terme de maladies, induits par ces échanges sont une réalité. Un autre élément à prendre en compte dans l'augmentation significative d'apparition ou d'émergence de ces maladies est l'évolution récente des techniques de diagnostics. Aujourd'hui, ces techniques sont très poussées et les analyses moléculaires permettent non seulement de détecter mais aussi de caractériser génétiquement des virus ou bactéries. En confirmant des similitudes ou au contraire des différences entre des souches de différents échantillons, ces études de séquences génétiques, montrent que des virus pourtant endémiques à certains pays, se propagent au-delà des frontières, voire à d'autres continents. Il est fondamental d'exploiter au mieux les informations générées par ces laboratoires pour faciliter la compréhension des flux d'agents pathogènes pour consécutivement, prendre des mesures de contrôle et limiter leur diffusion. Pour améliorer la connaissance des facteurs épidémiologiques impliqués dans la diffusion de maladies infectieuses, il est également important de rassembler des données sur les facteurs d'émergences des maladies animales et zoonotiques, d'en vérifier la qualité et homogénéité, et de les rendre disponibles pour des analyses épidémiologiques, en intéressant notamment à la mobilité animale. L'objectif de ce travail consiste à c