La question des relations entre les systèmes nationaux de recherche agricole et les organisations paysannes se trouve au coeur des réflexions de nombreux opérateurs de développement. Du discours incantatoire à la mise en pratique effective, le chemin paraît encore long. L'établissement d'un dialogue qui aboutisse à des modifications significatives des contenus et des modalités d'intervention de la recherche agricole est un processus d'apprentissage réciproque long et complexe entre des partenaires aux logiques différentes et qui suppose que soient éclaircies de nombreuses ambiguïtés sur les attentes, parfois fausses, suscitées par ce partenariat. Cette étude est une contribution au débat en cours; elle se fonde sur l'étude d'un cas concret, le Mali, à travers trois situations agricoles régionales: la région de Mopti, Niono dans le cadre de l'Office du Niger et le Mali-Sud. Dans ces trois situations au contexte économique et institutionnel fortement contrasté et marquées chacune par des histoires différentes en termes de dispositif d'intervention, les relations entre la recherche agricole et les organisations de producteurs ont été analysées et confrontées à la perception des principaux acteurs, les producteurs et les chercheurs. Cette étude n'a pas la prétention de faire un point exhaustif sur cette question complexe dans le cas du Mali à partir de missions relativement brèves. Cette étude n'est en aucun cas une appréciation spécifique du dispositif institutionnel mis en place par l'IER. Elle propose, à partir d'une analyse de ces trois situations, un éclairage argumenté par les observations de terrain sur les modalités des relations entre recherche et organisations de producteurs. Cette réflexion est ainsi replacée dans un cadre plus large situé par rapport aux travaux de la recherche anglophone sur ces questions qui fait l'objet d'une présentation analytique et de synthèse en annexe au présent document.