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Détection de QTL pour des caractères liés aux rejets chez le poulet de chair

Mignon-Grasteau S., Carré B., Gabriel I., Rideau N., Chantry-Darmon C., Boscher M.Y., Bastianelli D., Sellier N., Chabault M., Le Bihan-Duval E., Narcy A.. 2015. In : Onzièmes journées de la recherche avicole et palmipèdes à foie gras. Tours : ITAVI, p. 356-360. Journées de la recherche avicole et palmipèdes à foie gras. 11, 2015-03-25/2015-03-26, Tours (France).

L'efficacité digestive influe fortement sur l'excrétion et par conséquent l'impact environnemental de la production de poulet de chair. Nous avons recherché les zones du génome contrôlant des caractéristiques importantes des rejets sur un croisement F2 entre deux lignées sélectionnées de façon divergente sur l'efficacité digestive. Au total, 865 animaux ont été mesurés pour les quantités brutes de fientes fraîches et sèches (PFF, PFS) et leur rapport à la consommation alimentaire de fientes fraîches et sèches (PFFC, PFSC), le contenu en eau des fientes (EAU), le rapport entre azote et phosphore dans les fientes (N/P), le pH des fientes, du contenu du gésier et du contenu du jéjunum (PHF, PHG, PHJ). L'ensemble des animaux (F0, F1, F2) a été génotypé avec 6000 marqueurs SNP couvrant 28 autosomes, un groupe de liaison non assigné et le chromosome Z. Au total, 11 QTLs ont été identifiés pour : PFS (GGA19, GGA26), PFFC (GGA8), PFSC (GGA16), N/P (GGA11, GGA26), EAU (GGA28), PHG (GGA2, GGA16, GGA27) et PHJ (GGA19). Le QTL du pH du gésier sur le chromosome 2 est le plus significatif (P=0,15 au niveau du génome), les autres QTLs n'étant significatifs qu'au niveau du chromosome. Sur les chromosomes 16 et 27, ces QTLs co-localisent avec des QTLs d'efficacité digestive. Sur les chromosomes 8, 16 et 26, ces QTLs co-localisent avec des QTLs de longueur relative de l'intestin. Des travaux sont actuellement en cours pour confronter les données d'expression de gènes sur les tissus du tractus gastro-intestinal et les données de génomique positionnelle présentées ici afin de suggérer des gènes candidats expliquant ces QTLs.

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