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Modélisation écophysiologique et analyse génétique pour la recherche de génotypes de tournesol adaptés aux basses températures causées par des semis précoces

Allinne C.. 2009. Toulouse : Université de Toulouse, 159 p.. Thèse de doctorat -- Agrosystèmes, écosystèmes et environnement.

Le semis précoce du tournesol, d'un à deux mois par rapport à la période habituelle (Avril dans le sud ouest de la France), a été envisagé pour esquiver les périodes de sécheresses estivales. Cette stratégie conduit à un abaissement des températures de l'ordre de 5 à 10°C durant les premières phases de développement de la culture. L'objectif de ce travail est donc d'identifier des génotypes de tournesol adaptés à des conditions de basses températures en début de cycle, et de fournir des outils pour la sélection de ces nouveaux idéotypes. Dans un premier temps le modèle de culture SUNFLO, développé pour l'analyse des interactions génotype x environnement chez le tournesol, a été utilisé pour identifier par simulation un idéotype pour le semis précoce. Cette étude a révélé que le type variétal valorisant le mieux de semis précoce présente une levée précoce et un cycle tardif. Dans un deuxième temps, la variabilité génétique d'une population de lignées recombinantes de tournesol a été une analysée pour des traits agro-morphologiques et physiologiques caractérisant le développement (vitesse de germination, phénologie) et la croissance à basse température (élongation de l'hypocotyle, production de biomasse, et traits physiologiques impliqués dans la tolérance au froid). L'analyse génétique de ces caractères a permis d'identifier les régions chromosomiques impliquées dans la variation de ces caractères (QTLs) ainsi que les marqueurs moléculaires associés à ces QTLs qui représentent des marqueurs d'intérêts pour la sélection. L'analyse des processus impliqués dans la levée (germination et élongation de l'hypocotyle) montre que la température de base pour l'élongation de l'hypocotyle présente un gain génétique significatif à basse température. Ce trait est sous le contrôle génétique de deux QTLs majeurs dont l'un, qui explique 40% de la variabilité phénotypique observée, est lié au marqueur SSR ORS1128. Le temps thermique du semis à la floraison est un caractère contrôlé pa

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