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Modélisation de la dynamique temporelle et de la distribution spatiale des Culicoides (Diptera: Ceratopogonidae) au Sénégal

Diarra M.. 2015. Saint-Louis : Université Gaston Berger, 209 p.. Thèse de doctorat -- Statistiques appliquées.

L'épizootie de peste équine de 2007 au Sénégal a engendré de nombreuses mortalités dans la population équine et donc des pertes économiques considérables estimées à 1,4 million d'euros. Les vecteurs impliqués dans la transmission de cette maladie n'ont jamais fait l'objet d'études spécifiques au Sénégal. Nous proposons ici de contribuer à l'évaluation du risque de transmission du virus de la peste équine et/ou de la FCO au Sénégal en développant des modèles statistiques de dynamique temporelle et de distribution d'abondance spatiale des Culicoides potentiellement vecteurs de la maladie, en fonction de facteurs climatiques et environnementaux. Dans la zone des Niayes, malgré la modélisation d'importantes quantités de Culicoides capturés dans les pièges OVI, la surdispersion a persisté dans le modèle de Poisson, de la binomiale négative, du modèle mixte de Poisson avec effets aléatoires site de capture. Seul le modèle mixte de Poisson avec effets aléatoires site et date de capture a pu prendre en compte la surdispersion. Dans les données issues des pièges à appât cheval, la binomiale négative a pris en compte la surdispersion présente dans le modèle de Poisson. Selon ces modèles validés, les variables environnementaux et climatiques qui influencent la dynamique d'abondance de C. imicola et C. oxystoma ont été identifiées. Des modèles spatiaux de distribution d'abondance des 5 espèces d'intérêt vétérinaire, ont été élaborés grâce aux données provenant de la campagne nationale de piégeage de 2012 au Sénégal. Selon le modèle RF (random forest) qui a fourni des estimations d'abondance meilleures que le modèle GLM (modèles linéaires généralisés), les variables climatiques et environnementales d'importance qui influencent sur la distribution d'abondance spatiale des espèces ont été identifiées. Les cartes de prédiction du modèle RF pour chacune des 5 espèces montrent de fortes abondances dans le sud du Sénégal et le bassin arachidier. Les résultats suggèrent que d'autres ve

Mots-clés : culicoides; dynamique des populations; distribution spatiale; facteur climatique; vecteur de maladie; distribution géographique; transmission des maladies; modèle mathématique; modèle de simulation; analyse du risque; fièvre catarrhale ovine; peste équine africaine; sénégal

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