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Epidémiologie des virus influenza dans les élevages multi-espèces tropicaux

Trévennec K.. 2011. Montpellier : Université Montpellier 2, 142 p.. Thèse de doctorat -- Epidémiologie, Thèse de doctorat -- Epidémiologie.

Les élevages multi-espèces en Asie du Sud-est regroupent sur un même site 3 hôtes potentiels de virus influenza : volailles, pores, hommes. Le contexte épidémiologique dans cette région révèle que les virus influenza circulent activement chez chacun de ces 3 hôtes. Chacune de ces espèces est le réservoir de sous-types viraux qui lui sont spécifiques, mais qui ont déjà montre par le passe leur aptitude à franchir la barrière d'espèce pour infecter un nouvel hôte. Une transmission interspécifique peut aboutir à une émergence virale, éventuellement a potentiel pandémique. L'objectif de ce travail est d'estimer le risque de circulation intra et inter-espèce des virus influenza associes aux élevages mixtes porc-volaille au Vietnam et d'en identifier les déterminants épidémiologiques. Apres avoir effectué un bilan des connaissances virologiques, sérologiques et épidémiologiques sur l'influenza porcin et aviaire au Vietnam, 2 séries d'enquêtes sont mises en place dans des agroécosystèmes varies: la zone périurbaine du Delta du Fleuve Rouge, caractérisée par ses fortes densités animale et humaine; et la zone des montagnes du Nord, caractérisée par des systèmes d'élevage traditionnels. Les enquêtes se situent respectivement dans des contextes d'émergence du virus pandémique H1N1/ 2009 et d'influenza aviaire hautement pathogène H5N5. En l'absence d'isolement viral, la sérologie représente le principal outil d'investigation pour estimer le risque et identifier les facteurs de risque d'infection par les virus influenza chez les différentes espèces hôtes. Les élevages traditionnels du Sud-est asiatique jouent probablement un rôle central dans l'épidémiologie des virus influenza et le risque d'émergence, mais ils ne sont que très rarement étudiés. Les résultats originaux et les discussions issues des enquêtes de terrain contribuent à améliorer notre compréhension de la circulation des virus influenza entre les différents hôtes en conditions naturelles.

Mots-clés : bétail; zone tropicale; influenzavirus; surveillance épidémiologique; Épidémiologie

Thématique : Maladies des animaux; Elevage - Considérations générales

Thèse