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Etude des bases génétiques de l'efficience de l'utilisation de l'azote du riz pluvial (Oryza sativa L.) à Madagascar

Rakotoson L.T.. 2019. Antananarivo : Université d'Antananarivo, 214 p.. Thèse de doctorat -- Biotechnologie.

La riziculture pluviale prend une place importante dans les exploitations agricoles Malagasy, en particulier sur les " tanety " des Hautes terres et du Moyen Ouest. Pourtant, les sols de " tanety " sont souvent très peu fertiles, notamment, en azote, qui est un facteur limitant du rendement des céréales comme le riz. De plus, les riziculteurs n'ont pas les moyens d'apporter des engrais chimiques et les rendements restent très faibles. L'enjeu de l'amélioration de l'efficience de l'utilisation de l'azote (NUE) est donc crucial dans ce contexte d'agriculture de subsistance ayant très peu recours aux engrais chimiques. La création de variétés pour ces systèmes à bas niveau d'intrants doit être envisagée. L'objectif global de cette étude est donc de contribuer à une meilleure compréhension du déterminisme génétique du NUE du riz pluvial et de l'élaboration du rendement en grains en fonction de la nutrition azotée. Pour ce faire, deux expérimentations ont été menées à Ivory, dans le Moyen Ouest de Madagascar, pendant quatre campagnes successives (2012 à 2016) pour évaluer le niveau de variabilité génétique existant pour NUE et d'autres caractères agronomiques, et pour identifier les régions chromosomiques responsables de la variation de ces caractères sur le riz pluvial, à l'aide de la génétique d'association (GWAS). La première expérimentation a été menée sur 13 variétés de riz pluvial dans un dispositif en bloc randomisé avec six répétitions et deux niveaux de fertilisation azotée (faible et fort), pendant trois campagnes (2012 à 2015). Au total, 21 caractères ont été mesurés dont le NUE et ses composantes ainsi que le rendement en grains (GY) et ses composantes. Une variabilité génétique pour NUE et ses deux composantes, ainsi que pour tous les autres caractères mesurés, a été montrée sur le riz pluvial. La variation de l'efficience de l'absorption de l'azote (NUPE) contribue le plus, fortement, à la variation de NUE, quel que soit le niveau d'azote du milieu. Nous n'

Mots-clés : oryza sativa; riz pluvial; nutrition des plantes; azote; paramètre génétique; phénotype; rendement des cultures; madagascar

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