L'accélération des travaux sur l'édition du génome renouvelle les innovations liées aux biotechnologies dans le secteur agricole et alimentaire. Elle interpelle en filiation la capacité à évaluer les risques et incertitudes dans le contexte des pays en développement. Nous proposons dans cette étude de diagnostiquer la capacité institutionnelle des pays en développement ciblés comme des utilisateurs des produits dérivés des organismes génétiquement édités. D'un point de vue méthodologique, nous caractérisons par des enquêtes à dire d'expert le système d'évaluation des risques existant à Madagascar et les méthodes mobilisées. Les personnes ressources enquêtées font partie des organes de biosécurité au niveau national. Les résultats montrent que le dispositif méthodologique potentiellement applicable pour l'évaluation des risques des Plantes Génétiquement Edités n'est pas fonctionnel faute de textes juridiques validés ou peu appliqués. La communauté scientifique impliquée dans le processus d'évaluation ne dispose pas de toutes les ressources nécessaires. Les laboratoires considérés comme points focaux de la biosécurité à Madagascar ne sont pas encore accrédités. En ce qui concerne l'évaluation des risques socio-économiques, les méthodologies mobilisées ne traitent pas ou peu de ce domaine. Les mécanismes de concertation de la société civile impliquent les acteurs socio-économiques dans les mécanismes de gouvernance de l'évaluation des risques existent mais sont peu documentés par des expériences concrètes. Le cadre méthodologique permettant de mobiliser les connaissances et apprentissages collectives générés sur les risques n'est pas en place. Ce contexte plaide pour un renforcement symétrique des capacités scientifiques et techniques nationales à analyser les risques d'une part et à mettre en place des dispositifs et des méthodes d'implication de la société civile qui permettent une réelle caractérisation sociétale des indicateurs de coûts-bénéfices de l'utilisation d