Le complexe d'espèces Dioscorea cayenensis - Dioscorea rotundata est l'igname la plus cultivée de l'Afrique de l'ouest. Il a été décrit comme résultant de la domestication, par les paysans africains, de formes sauvages d'ignames appartenant à la section Enanthiophyllum. Dans le but de répondre à des interrogations concernant l'évolution de l'igname et d'essayer de compléter les connaissances sur les relations phylogéniques entre les espèces cultivées et les espèces sauvages au Bénin, nous avons étudié la variation du nombre de répétitions de motifs simples de l'ADN chloroplastique (cpSSR) dans 148 accessions d'igname élaborées pour couvrir la diversité génétique présente dans le pays. Dioscorea cayenensis et D. rotundata ont montré le même haplotype. Le morphotype "abyssinica" est subdivisé en 2 haplotypes. L'un des deux partage son haplotype avec le complexe d'espèces Dioscorea cayenensis - Dioscorea rotundata et les morphotypes praehensilis, suggérant qu'ils pourraient appartenir à la même espèce. Les relations entre les sections Lasiophyton, Macrocapaea, Opsophyton et Enanthiophyllum sont plus clarifiées et au sein de la section Enanthiophyllum des modifications taxonomiques sont proposées. Dioscorea minutiflora, D. smilacifolia et D. burkilliana pourraient être considérées comme appartenant au même groupe génétique et probablement à la même espèce.