La durée minimale d'indexage des virus sur le bananier est de 6 mois, ce qui correspond à l'apparition de 8 feuilles fonctionnelles. La première indexation est réalisée 3 mois après plantation en serre, la deuxième à la fin de la période d'indexation. L'indexation consiste pour le BBTV et le CMV à l'utilisation des kits de diagnostic Elisa; pour le BBMV et autres virus, tous les bananiers sont systématiquement analysés, après la semi-purification du pathogène dans l'échantillon, par observation par microscopie électronique et pour le BSV par immuno-électromicroscopie