Les marqueurs moléculaires sont utilisés pour caractériser des hybrides interspécifiques entre S. officinarum et E. arundinaceus. Des outils simples de diagnostic pour détecter les hybrides dans la descendance ont été utilisés à partir de l'électrophorèse d'isozymes et la technique PCR. La forte différentiation moléculaire entre S. officinarum et E. arundinaceus a permis l'identification de bandes RFLP spécifiques d'Erianthus dans les hybrides. L'hybridation in situ d'ADN génomique a permis la différentiation des chromosomes parentaux ayant contribué au croisement dans les préparations de chromosomes des hybrides. Les potentialités de ces techniques pour suivre le génome d'Erianthus pendant le processus d'introgression est discuté