Publications des agents du Cirad

Cirad

Isolation and characterization of a satellite DNA family in the Saccharum complex

Alix K., Baurens F.C., Paulet F., Glaszmann J.C., D'Hont A.. 1998. Genome (Ottawa), 41 : p. 854-864.

DOI: 10.1139/gen-41-6-854

La migration électrophorétique, sur gel d'agarose, de fragments résultant d'une restriction par l'endonucléase Taql d'ADN génomique, a permie d'isoler un ADN satellite de 371 pb spécifique du genre Erianthus, EaCIRI. Cette séquence présente 77% d'homologie avec un ADN satellite de 365 pb spécifique de Helictotrichon convolutum, ainsi que 72% d'homologie avec une séquence répétée en tandem de 353 pb spécifique de Oryza sativa. Des amorces PCR définies dans les zones conservées de ces séquences répétées ont permis d'isoler d'autres ADN satellites chez différents représentants du complexe Saccharum : SoCIRI chez Saccharum officinarum. SrCIR1 chez Sacharum robustum, SsCIR1 et SsCIR2 chez Saccharum spontaneum ainsi que MsCIR1 chez Miscanthus sinensis. EaCIR1 et SoCIR1 ont été localisés dans les régions subtélométriques des chromosomes, par hybridation in situ en fluorescence. La réalisation d'hybridations de type Southern, en utilisant deux représentants de cette famille de séquences répétées comme sondes, a illustré l'existence de la spécificité d'espèce de ces satellites, et démontré l'existence d'éléments répétés similaires chez le sorgho et la maïs.

Mots-clés : saccharum; adn; électrophorèse; erianthus; séquence nucléotidique; pcr; miscanthus sinensis; hybridation

Article (a-revue à facteur d'impact)

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