L'utilisation de critères biochimiques, pour la taxonomie des espèces de Phytophthora, agents de la pourriture brune des cabosses de cacaoyer, a été recherchée en analysant 659 isolats au niveau des profils isoenzymatiques. Sur 25 systèmes enzymatiques actifs en électrophorèse sur amidon, 10 présentent une bonne résolution. Deux de ces systèmes, les PGI et les MDH, apparaissent comme des marqueurs spécifiques car ils permettent d'identifier rapidement les différentes espèces de Phytophthora responsables de la pourriture brune du cacaoyer : P. megakarya avec des souches de l'Afrique de l'Ouest et de Sao Tomé; P. palmivora avec des souches d'Afrique, de Sao Tomé, d'Amérique latine et d'Asie. Au cours des analyses, deux autres espèces ont pu être mises en évidence sur cabosses malades, P. nicotianae var. parasitica (Cuba), et P. arecae (Philippines et Vanuatu)