La répartition spatiale des arbres reflète les mécanismes biologiques qui influent la croissance des arbres (exigences édaphiques, compétition, etc.). On cherche donc à définir une distance entre deux espèces en s'appuyant sur la répartition spatiale des arbres, ce qui revient à définir une distance entre deux nuages de points. Plusieurs indices de dissimilarité entre nuages de points sont définis. Huit d'entre eux sont étudiés plus précisément, en simulant des répartitions spatiales à l'aide de processus ponctules, et en regardant le comportement de chacun des indices sur ces simulations. Les indices ne répondent pas tous à la même question; parmi ceux qui répondent à la même question, certains sont plus performants que d'autres. Les indices sont ensuite mis en application dans deux cas concrets: une forêt de la côte nord ouest du Pacifique, près de Vancouver (Canada), et la forêt de Paracou en Guyane française. Ces deux forêts diffèrent par la complexité des interactions entre espèces. Les indices permettent de caractériser assez précisément les relations entre espèces dans la forêt de Colombie Britannique, mais sont beaucoup moins concluants pour la forêt guyanaise.