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Couplage de modèles de flux de gènes et de modèles de dynamique forestière

Dreyfus P., Pichot C., De Coligny F., Gourlet-Fleury S., Cornu G., Jésel S., Dessard H., Oddou-Muratorio S., Gerber S., Caron P., Latouche-Hallé C., Lefèvre F., Courbet F., Seynave I.. 2005. In : Un dialogue pour la diversité génétique : 5e Colloque National BRG - ISARA, Lyon, 3-4-5 novembre 2004. Paris : BRG, p. 231-250. (Les Actes du BRG, 5). Colloque national BRG Dialogue pour la diversité génétique. 5, 2004-11-03/2004-11-05, Lyon (France).

La gestion forestière vise des objectifs multiples: fonctions économiques, écologiques, sociales; maintien de la diversité, du rendement; pérennité des formations; gestion et conservation des ressources génétiques. Sur la base de connaissances et de modèles disponibles en matière de flux de gènes et de dynamique forestière, cette étude a permis: (1) l'élaboration d'un modèle démogénétique général prenant en compte simultanément les processus de reproduction (production et dispersion des graines et du pollen en lien avec la phénologie), de régénération ou recrutement, de croissance, compétition et mortalité; (2) l'implémentation informatique d'un tel modèle et l'intégration logicielle des relations disponibles pour cinq situations forestières diverses au sein d'une plate-forme de simulation qui mutualise des fonctionnalités génériques (création d'une bibliothèque "Genetics") tout en étant suffisamment modulaire, ouverte, et accessible aux chercheurs et aux utilisateurs; (3) la réalisation de simulations destinées, pour chaque situation étudiée, d'une part à identifier les éléments les plus sensibles du modèle démogénétique et les processus dont l'étude doit être approfondie et d'autre part à comparer divers modes de gestion forestière (sylviculture, exploitation forestière) pour ébaucher des indications quant à leurs effets sur les ressources génétiques.

Mots-clés : modèle mathématique; simulation; application des ordinateurs; forêt; flux de gènes; reproduction; régénération; compétition végétale; croissance; dynamique des populations; sylviculture; forêt mélangée; zone tropicale; zone tempérée; forêt feuillue; forêt résineuse; informatique

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