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Identificação rapida de marcadores SSR polimorficos em Coffea arabica : [Resumo]

Ferreira R.V., Santos M.A., Charmetant P., Marraccini P., Leroy T., Vieira L.G.E., Sera T., Pereira L.F.P., Pot D.. 2010. In : Sociedade Brasileira de Genética. Resumos do 56° Congresso Brasileiro de Genética, 14 a 17 de setembro de 2010, Guaruja, Brasil. s.l. : s.n., p. 8-8. Congresso Brasileiro de Genética. 56, 2010-09-14/2010-09-17, Guaruja (Brésil).

Marcadores moleculares SSR são ferramentas importantes nos estudos de diversidade e caracterização de bancos de germoplasma de plantas cultivadas. Entretanto, a identificação de um conjunto mínimo de SSR úteis para discriminar os diferentes genótipos pode implicar na análise de um grande número de marcadores. Em Coffea arabica a maioria desses marcadores apresentam um baixo padrão de polimorfismo, o que constitui um dos principais gargalos para os estudos de caracterização genotípica do germoplasma da espécie. O objetivo deste trabalho foi desenvolver uma metodologia de avaliação rápida de SSR visando identificar marcadores polimórficos com um número mínimo de processos de genotipagem. A metodologia empregada constitui numa adaptação da técnica BSA (Bulk Segregant Analysis) utilizada comumente para identificar associações entre marcadores e genes qualitativos em populações biparentais. Para identificar os SSRs polimórficos de uma população de 130 genótipos da Etiópia, centro de origem de C. arabica, foram constituídos, com base em dados de diversidade fenotípica, três grupos para análise: um com 6 plantas representando genótipos do leste, outro com 8 plantas representando genótipos do oeste do Vale do Rift e um terceiro grupo representado por um único genótipo. Para cada marcador SSR foram realizadas três reações de amplificação a partir de "pools" formados pelo material genético dos grupos. Em uma única placa de 96 poços foi possível avaliar o polimorfismo de 32 marcadores. Os marcadores que apresentaram um padrão polimórfico entre os grupos foram então avaliados no painel de genótipos em estudo. Para efeitos de comparação entre a genotipagem padrão e a adaptação proposta neste trabalho foram estimados o número de reações de amplificação e de géis de poliacrilamida gastos para a avaliação de 100 SSR em um painel de 24 genótipos considerando uma margem de 10% de marcadores polimórficos. Pelo processo normal de genotipagem, seriam necessários 2400 reações de ampl

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