A perda de carbono (C) orgânico devido ao uso inadequado do solo afeta as propriedades químicas, físicas e biológicas e torna o solo uma fonte de CO2 para a atmosfera. O objetivo desse estudo foi avaliar o efeito de sistemas de uso do solo no conteúdo carbono orgânico total (COT), C oxidável (Cox) e C recalcitrante (CRec) da matéria orgânica do solo (MOS) em região sub-tropical e tropical. Este trabalho foi realizado em Ponta Grossa (PG, PR região subtropical) em um Latossolo Vermelho (675 g kg-1 de argila) com 29 anos sob preparo convencional (PC) e plantio direto (PD), e em Lucas do Rio Verde (LRV, MT, região tropical), em um Latossolo Vermelho Amarelo (490 g kg-1 de argila) com 8 anos sob PC e PD. Nos dois locais foi selecionada a vegetação nativa (VN) de cerrado (LRV) e floresta (IAPAR) como referência. A profundidade de amostragem nos dois locais foi: 0-5; 5-10, 10-20; 20-40; 40-60; 60-80; 80-100 cm. O conteúdo de COT (80,7 g kg-1) em PG na camada de 0-5 cm em solo sob VN foi 2,3 vezes superior ao PC (35,0 g kg-1) e a perda total em 29 anos foi de 45,7 g kg-1 cuja taxa anual foi de 1,58 g kg-1. Em contraste, o conteúdo de COT no PD (62,5 g kg-1) foi 1,29 vezes inferior ao VN e recuperou 34,1% do COT perdido com o PC em relação ao VN. Em região tropical a perda de C (VN = 38,3 g kg-1) com o PC (18,3 g kg-1) foi de 20 g kg-1 representando 52,2 % e 2,5 g kg-1 ano-1 de C e 1,6 vezes superior à região subtropical. Da mesma forma a recuperação com os sistemas de produção em PD (23,8 g kg-1) recuperaram 30,0% do COT em relação ao PC. Abaixo da camada de 20 cm não se constatou diferenças significativas entre os sistemas de uso do solo. O conteúdo de COx apresentou a mesma tendência do COT. Foi observado que a proporção de C recalcitrante aumentou com a diminução do C em profundidade e variou de 14% na camada superficial para 49% nas camadas mais profundas. Em condição subtropical, o conteúdo do CRec diferiu significativamente entre os modos de uso da terra na camada su