Introduction : Les systèmes agroforestiers sont des agro-écosystèmes où sont associés des arbres et des cultures ou des prairies au sein d'une même parcelle. Ces systèmes fournissent un ensemble de services écosystémiques, et pourraient contribuer à l'atténuation du changement climatique. Du carbone est stocké dans la biomasse aérienne et souterraine des arbres, et les apports en matières organiques provenant des arbres pourraient avoir un impact positif sur les stocks de carbone organique du sol. Cependant, en milieu tempéré très peu d'études se sont intéressées à l'impact des systèmes agroforestiers sur le stockage de carbone organique dans les sols, la majorité ayant été menées en zones tropicales. De plus, beaucoup de questions demeurent quant à l'impact sur les stocks de carbone profonds. Méthode : Cette étude a été réalisée sur cinq sites agro-sylvicoles (arbres et cultures) et sur un site sylvopastoral (arbres et prairie pâturée) en France. Chaque site comprenait une parcelle agroforestière et une parcelle agricole adjacente comme parcelle témoin. Les itinéraires techniques dans les inter-rangs agroforestiers cultivés et dans les parcelles agricoles sont strictement identiques depuis la plantation des arbres, âgés de 6 à 41 ans selon les sites. Les prélèvements au cylindre ont été réalisés entre 20 et 100 cm de profondeur selon un protocole d'échantillonnage prenant en compte la distance aux arbres, et les stocks de carbone organique du sol mesurés à masse de sol équivalente. La biomasse aérienne des arbres a également été mesurée sur les différents sites. Résultats et discussion : Dans les parcelles agro-sylvicoles, un taux d'accumulation moyen de 0,24 (0,09-0,46) t C ha-1 an-1 a été mesuré sur l'horizon 0-30 cm par apport aux parcelles agricoles. Un stockage de carbone additionnel a également été mesuré en profondeur sur les sites les plus anciens. Dans les jeunes plantations, le stockage de carbone était principalement localisé sur les lignes d'arbres, et