Le genre Cylindrocladium comprend une trentaines d'espèces phytopathogènes dont la plupart présentent une forme sexuée ascomycète appartenant au genre Calonectria. Les espèces à conidies droites représentent un taxon dans lequel une identification spécifique est problématique. Une analyse du polymorphisme des espaceurs du rDNA a été réalisée sur 25 isolats de référence représentant 10 espèces afin de mettre au point une méthode moléculaire simple d'identification des ces champignons.