La maladie des raies noires causée par M. fijiensis est considérée comme l'une des principale menaces des bananiers. Cette maladie s'étend inexorablement aux principales régions bananières et supplante la Cercosporiose jaune causée par M. musicola. Une étude de population de ces Mycosphaerella spp, pathogènes des bananiers et plantains, par RFLP (polymorphisme de longueur de fragments de restriction), a été initiée. Une méthode d'extraction d'ADN total adaptée à ces espèces a été mise au point. Des hybridations avec une sonde hétérologue correspondant à l'ADNr de Sordaria macrospora nous ont permis de détecter un polymorphisme interspécifique et entre isolats de M. fijiensis d'origine géographique différente. L'espèce M. musicola semble plus homogène. Ces observations seraient en accord avec l'activité pathogène supérieure de l'espèce M. fijiensis.