Les Pseudomonas fluorescents associés à la pourriture brune du riz ont été isolés à partir de riz cultivés à basse et haute altitude dans diverses zones géographiques et analysés pour leur pouvoir pathogène et leur diversité phénotypique et génétique. Les souches standards des différentes espèces du groupe I ont été analysées avec les isolats collectés au champ. La caractérisation biochimique a révélé 23 groupes définis par différentes caractéristiques nutritionnelles. 19 des 35 isolats de riz ont été identifiés comme P. fuscovaginae (groupe biochimique G1). En utilisant les techniques PCR et RFLP, 25 haplotypes ont été découverts. L'analyse de parcimonie a révélé que les isolats de P. fuscovaginae étaient répartis en 4 haplotypes, mais qu'ils formaient un groupe qui les différenciait du groupe I des espèces de Pseudomonas. Tous les isolats récoltés au champ et introduits par injection ont été pathogènes pour le riz. L'inoculation du riz sans blessure au stade du bourgeonnement a montré que seulement les 4 haplotypes de P. fuscovaginae et les isolats avec les haplotypes 7, 9 et 17 ont été pathogènes. Ainsi, les populations de riz, associées avec des pseudomonas fluorescents, ont contenu différents isolats pathogènes du riz seulement après blessure